probablemente una ranura de 10 cm de ancho en el suelo no tiene ninguna relevancia estructural. quizás bastan menos centímetros de profundidad, dependiendo de la composición del suelo.
claro que es un problema cuando el arquitecto también es tu perito. una segunda opinión independiente habría sido sin duda mejor.
lo que por supuesto no está en absoluto permitido es la elevación del suelo. en obra nueva bajo ninguna circunstancia. quizás consideraría algo así por 30.000€, pero no por la poca plata que probablemente puedan pagar. entonces más bien una nueva solera, aunque aquí no será necesario.
las tuberías mal colocadas son bastante frecuentes.