Entonces, en la mayoría de las herramientas de este tipo incluso se pueden exportar datos a Excel, etc., pero por supuesto, la solución vive de que todos la usen por igual. Sin embargo, esto no es diferente a lo que pasa con Excel, PDF, etc., solo que ahí la difusión es mayor, y ahora también el número de herramientas de terceros, aunque en parte todavía con calidad de soporte dudosa. Ahora mismo no me viene a la mente ningún estándar abierto para el almacenamiento de metadatos de proyectos, pero incluso si existiera algo así, tendrían que existir varios clientes compatibles para permitir que cada empleado use SU herramienta. Con Excel, nadie pregunta por esta individualidad. :D
Al final, Excel probablemente es tan popular porque representa un denominador común mínimo, aunque para mí definitivamente sería demasiado pequeño para hacer una gestión de proyectos adecuada. Por supuesto, si las demandas son menores, disminuye la atractividad de una solución especializada, pero eso no la hace peor.